Las primeras semillas aparecieron a finales del periodo Devónico, hace unos 372 millones de años. Los científicos creen que los prerrequisitos para su aparición comenzaron a formarse después de que las plantas surgieran en tierra hace unos 450 millones de años.
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Antes de que aparecieran las semillas, plantas antiguas como los musgos y los helechos se reproducían por esporas. En cambio, las semillas son estructuras multicelulares que se forman inmediatamente después de la fecundación. Las esporas, en cambio, son unicelulares y necesitan desarrollarse hasta una fase especial antes de germinar.